La tranquillité du peuple Akémi, qui vit dans le Grand-Arbre au-dessus d'une mer de nuages, est menacée par d'inquiétants troubles, dont la peste cendrée, un mal étrange qui ronge l'arbre et ses habitants. Pour en découvrir l'origine, la jeune Acacia et le chasseur Bao-Bao débutent un périple vers le plus profond du titanesque végétal.